Docteur en biologie cellulaire
Mail: Jl.bonnefont@institut-paul-ricard.org
Microbiologiste de formation, il participe dès les années 1980 aux travaux de l’Institut océanographique, d’abord dans le cadre d’une thèse, puis comme chercheur associé. Les travaux portent sur les microorganismes d’intérêt sanitaire, la biodégradation des hydrocarbures et sur la microbiologie marine en général. Salarié en 2008 comme responsable des travaux scientifiques, il devient directeur de la Recherche en 2012. A ce titre, et en cohérence avec la mission de l’Institut, il définit les orientations scientifiques et s’assure de la mise en œuvre et de la gestion des projets de recherche.
PUBLICATIONS
MARTIN Y, BONNEFONT J.L, et CHANCERELLE L., 2002. Gorgonians mass mortality during the 1999 late summer in French Mediterranean coastal waters : the bacterial hypothesys. Water Research 36: 779-782.
ROUANET E., LELONG P., MARTIN Y. et BONNEFONT J-L., 2008a. Site Natura 2000 FR 9302001 Lagune du Brusc – Volet A : analyse bibliographique. Contrat Communauté d’Agglomération Toulon Provence Méditerranée – Institut Océanographique Paul Ricard : 55 p.
ROUANET E., LELONG P., LECALARD C., REBILLARD D., MAUFFRAY M., RAUBY T., AUBLANC P., BONNEFONT J-L. et MARTIN Y., 2008c. Site Natura 2000 FR 9302001 Lagune du Brusc – Volet C : inventaire et cartographie ses habitats naturels. Contrat Communauté d’Agglomération Toulon Provence Méditerranée – Institut Océanographique Paul Ricard : 127 p.
ROUANET E., BONNEFONT J-L., LELONG P. et DURAND R., 2009a – Site Natura 2000 FR 9302001 Lagune du Brusc – Documents d’Objectifs – Tome 1 : Diagnostics écologiques et socio-économiques, enjeux et objectifs de conservation hiérarchisés. Institut Océanographique Paul Ricard – Six-Fours-les-Plages : 88 p + annexes 79 p.
ROUANET E., BONNEFONT J-L., LELONG P. et DURAND R., 2009b – Site Natura 2000 FR 9302001 Lagune du Brusc – Documents d’Objectifs – Tome 1 : Diagnostics écologiques et socio-économiques, enjeux et objectifs de conservation hiérarchisés – Fiches descriptives des habitats et espèces d’intérêt communautaire. Institut Océanographique Paul Ricard – Six-Fours-les-Plages : 75 p.
ROUANET E., BONNEFONT J-L., LELONG P. et DURAND R., 2009c – Site Natura 2000 FR 9302001 Lagune du Brusc – Documents d’Objectifs – Tome 1 : Diagnostics écologiques et socio-économiques, enjeux et objectifs de conservation hiérarchisés – Atlas cartographique. Institut Océanographique Paul Ricard – Six-Fours-les-Plages : 21 p.
ROUANET E., BONNEFONT J-L., LELONG P. et DURAND R., 2009d – Site Natura 2000 FR 9302001 Lagune du Brusc – Documents d’Objectifs – Tome 1 : Diagnostics écologiques et socio-économiques, enjeux et objectifs de conservation hiérarchisés – Note de synthèse. Institut Océanographique Paul Ricard – Six-Fours-les-Plages : 31 p.
BONNEFONT J.L., MARTIN Y.P.et GUIENNET B., 1990. Etude expérimentale de la décroissance des bactéries fécales en milieu marin. Quantification, facteurs impliqués. Water Research ; 4, 3 : 267-273.
BONNEFONT J.L., MARTIN Y.P, 1991. Etude du devenir des bactéries test de contamination fécale dans l’eau de mer. Recherche de modèles de simulation. Science Technique Technologie, 18 : 18-21.
BONNEFONT J.L., MARTIN Y.P, 1993. Apport et devenir des bactéries fécales d’un rejet urbain en milieu marin. IIIe Symposium international Protection du milieu marin contre la pollution marine. Marseille, 1993.
BONNEFONT J.L, LELONG P., MARTIN Y. et VICENTE N., 2006. Bilan sur les espèces marines d’intérêt patrimonial autour de l’archipel des Embiez. Convention Agence de l’Eau n° 2005 0873- Institut Océanographique Paul Ricard : 13 P + annexes.
DUPRAY E., BALEUX B., BONNEFONT J.L., GUICHAQUA C., POMEPUY M., DERRIEN A., 1991. Apports en bactéries par les stations d’épuration. IFREMER. Actes de colloques 11 : 81-87.
FIANDRINO A., MARTIN Y., GOT P., BONNEFONT J.L., TROUSSELLIER M., 2003. Bacterial contamination of Mediterranean coastal seawater as affected by riverine inputs : simulation approach applied to a shellfish breeding area (Thau lagoon, France). Water Research 37/8: 1711-1722.
MARTIN Y.P., TROUSSELLIER M., BONNEFONT J.L., 1998. Adaptative responses of E.coli to marine environment stresses : a modeling approach on viability and dormancy concepts. Oceanologica Acta 21(6) 951-964.
MARTIN Y, BONNEFONT J.L, et CHANCERELLE L., 2002. Gorgonians mass mortality during the 1999 late summer in French Mediterranean coastal waters : the bacterial hypothesys. Water Research 36: 779-782.
TROUSSELLIER M., BONNEFONT J.L., COURTIES C., DERRIEN A., DUPRAY E., GAUTHIER M., GOURMELON M., JOUX F., LEBARON P., MARTIN Y., POMMEPUY M., 1998. Response of enteric bacteria to environmental stresses in seawater. Oceanologica Acta. 21(6) 965-981.
COUPE S., COUVRAY S., TARNOWSKA K., SIMIDE R., HACHFI L., PIERRE S., GAILLARD S., RICHARD S., PREVOT D’ALVISE N., GOUZE E., MARTIN Y., BONNEFONT J.L. , VICENTE N., GRILLASCA J.P., 2011. In situ spine sampling and Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) PCRs proved relevant methods for molecular studies on the sea urchin Paracentrotus lividus. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 409 (2011) 310–314
OTHMANIA. , BUNET R., BONNEFONT J.L., BRIAND J.F., CULIOLI G ., 2015. Settlement inhibition of marine biofilm bacteria and barnacle larvae by compounds isolated from the Mediterranean brown alga Taoniaatomaria. J Appl Phycol DOI 10.1007/s10811-015-0668-4
SYLVAIN COUVRAY, THOMAS MIARD, ROBERT BUNET, YVAN MARTIN, JOEL-PAUL GRILLASCA, JEAN-LUC BONNEFONT AND STEPHANE COUPE, 2015. Experimental release of Paracentrotus lividus sea urchin juveniles in exploited sites along the French Mediterranean coast. Journal of Shellfish Research, Vol. 34, No. 2, 1–9, 2015.